El programa de Ecología de la FUP desarrolla estudios de capacidad de carga, inventarios turísticos, caracterizaciones de flora y fauna, diseño de rutas y senderos que fomentan el diseño de servicios de guía y recorridos por la naturaleza, con iniciativas turísticas y de conservación.
Para lo anterior, se cuenta con un Centro experimental (jardín botánico), colección Botánica y biológica de referencia registrada ante el Instituto Humboldt, personal calificado y con experiencia en el tema, además de permisos de colecta para flora y fauna a nivel nacional.
Siendo este un programa de Ecología contamos con una visión holísticos que nos permite articular las necesidades del territorio con las potencialidades de los atractivos naturales para generar un servicio turístico sostenible articulado desde los componentes sociales, culturales y ambientales